Desolasi bertemakan Islamik. Syafiq berkata: "Ia mengenai kisah seorang lelaki yang diuji oleh Tuhan dan perlu mencari jalan pulang."[10] Muhammad Yusof menulis untuk The Vocket menghuraikan Desolasi berjaya lari daripada acuan ‘sedia ada’ Skop Productions dan mengajak masyarakat berfikir secara kritikal dan integral tentang konsep ontologi iaitu hakikat ketuhanan, kosmologi dan kemanusiaan. Beliau juga berhujah bahawa filem ini mempunyai acuan filem Inception (2010) dan Lucy (2014), namun diadun dengan nilai artistik berteraskan budaya Malaysia.[25]